Прошло совсем немного времени с того момента, как на Японских островах, больше известных ныне под названием Зоны 11, объявился мятежник - некто, называющий себя Зеро. По мере того, как он одерживает всё новые и новые победы над Британской Империей, слава Зеро растёт. Был сформирован Орден "Чёрных рыцарей", призванный защищать угнетённых и слабых от насилия и вседозволенности сильных мира сего.
Так говорил сам Зеро, скрывший лицо под маской, а британская аристократия прозвала этот орден террористами, и открыла на них охоту. После убийства принца Кловиса губернатором Зоны 11 была назначена принцесса Корнеллия. Ей в обязанности вменяется подавить волну протестов и уничтожит Зеро любыми способами. Вместе с Корнеллией в колонию прибывает её младшая сестра - Юфемия Британская. Между нею и случайно встреченным принцессой на улицах Зоны 11 пилотом найтмара Сузаку Куруруги завязываются романтические отношения. Юфемия знает, что он японец, и более того, сын врага. Общаясь с ним, она может запятнать свою репутацию.
Тема временем, за таинственной девушкой по имени СиСи тоже начата охота. Заполучить её стремятся, как принц Шнайзель, так и служители Культа и император. Сама СиСи находит убежище в стенах Академии Эшфорд.
А в Зоне 11 появляется двойник Зеро, действующий в явном намерении очернить его репутацию.